من عيوب نظرية بور/ أوجه القصور في نظرية بور:
1- لم تستطع تفسير الأطياف الخطية للذرات عديدة الالكترونات حيث أن أطياف هذه العناصر تتكون من خطوط صعبة التمييز لتداخل بعضها في بعض بطريقة معقدة" كذلك فشل في حساب مستويات الطاقة فيها.
2- لم تستطع تفسير وضوح خط عن آخر في نفس طيف ذرة الهيدروجين.
3- كذلك اعتبر المدار على أنه مسار دائري بالرغم من إدخال أعداد كم ثانوية، ولم تفسر اختلاف سمك الخطوط رغم أنها فسرت مواقع هذه الخطوط.
4- في تفسيراته ركز على صفات الالكترون كجسيم وأهمل الطبيعة الموجية له، كذلك أثبتت الدراسات عدم القدرة على تحديد مكان وسرعة الإلكترون في نفس اللحظة.